Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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