Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Exo5Q9CXP9 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Exo5Q9CXP9 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms