Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Use1Q9CQ56 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Use1Q9CQ56 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Use1Q9CQ56 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Use1Q9CQ56 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms