Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms