Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp11Q99K46 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Usp11Q99K46 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp11Q99K46 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp11Q99K46 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp11Q99K46 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Usp11Q99K46 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp11Q99K46 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp11Q99K46 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Usp11Q99K46 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Usp11Q99K46 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Usp11Q99K46 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Usp11Q99K46 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp11Q99K46 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Usp11Q99K46 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp11Q99K46 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp11Q99K46 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp11Q99K46 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp11Q99K46 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp11Q99K46 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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