Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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TrabdQ99JY4 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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TrabdQ99JY4 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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TrabdQ99JY4 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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TrabdQ99JY4 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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TrabdQ99JY4 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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TrabdQ99JY4 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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TrabdQ99JY4 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
TrabdQ99JY4 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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