Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

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Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Nek8Q91ZR4 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Nek8Q91ZR4 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Nek8Q91ZR4 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Nek8Q91ZR4 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Nek8Q91ZR4 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Nek8Q91ZR4 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Nek8Q91ZR4 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Nek8Q91ZR4 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Nek8Q91ZR4 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms