Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms