Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28aQ8K3Y3 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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