Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm27168-201ENSMUST00000183394 361 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 1810059H22Rik-207ENSMUST00000204809 289 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 AC154433.1-201ENSMUST00000224401 1183 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm14699-201ENSMUST00000122340 228 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm27675-201ENSMUST00000184527 94 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm36980-201ENSMUST00000195643 622 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm8828-201ENSMUST00000196786 1290 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm29328-212ENSMUST00000209182 1168 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm8268-201ENSMUST00000209683 458 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm18124-201ENSMUST00000210695 706 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Amigo3Q8C2S7 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms