Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Nek11Q8C0Q4 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Nek11Q8C0Q4 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Nek11Q8C0Q4 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Nek11Q8C0Q4 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Nek11Q8C0Q4 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Nek11Q8C0Q4 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Nek11Q8C0Q4 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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Nek11Q8C0Q4 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek11Q8C0Q4 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek11Q8C0Q4 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek11Q8C0Q4 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Nek11Q8C0Q4 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek11Q8C0Q4 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek11Q8C0Q4 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek11Q8C0Q4 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek11Q8C0Q4 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nek11Q8C0Q4 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Nek11Q8C0Q4 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Nek11Q8C0Q4 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek11Q8C0Q4 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Nek11Q8C0Q4 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek11Q8C0Q4 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Nek11Q8C0Q4 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Nek11Q8C0Q4 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek11Q8C0Q4 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek11Q8C0Q4 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek11Q8C0Q4 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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Nek11Q8C0Q4 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek11Q8C0Q4 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek11Q8C0Q4 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek11Q8C0Q4 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nek11Q8C0Q4 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Nek11Q8C0Q4 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms