Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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