Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Trim37Q6PCX9 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Trim37Q6PCX9 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim37Q6PCX9 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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