Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Cacna2d3-208ENSMUST00000225985 918 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Gm5291-201ENSMUST00000201965 899 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Rps14-201ENSMUST00000025511 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
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NipblQ6KCD5 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Gm20483-201ENSMUST00000173162 851 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Gpx6-201ENSMUST00000004453 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
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