Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms