Protein–RNA interactions for Protein: Q64674

Srm, Spermidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmQ64674 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SrmQ64674 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms