Protein–RNA interactions for Protein: Q64336

Tbr1, T-box brain protein 1, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbr1Q64336 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Tbr1Q64336 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Tbr1Q64336 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Tbr1Q64336 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Tbr1Q64336 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Tbr1Q64336 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Tbr1Q64336 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tbr1Q64336 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tbr1Q64336 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tbr1Q64336 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Tbr1Q64336 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tbr1Q64336 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tbr1Q64336 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Tbr1Q64336 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tbr1Q64336 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tbr1Q64336 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tbr1Q64336 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tbr1Q64336 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tbr1Q64336 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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Tbr1Q64336 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Tbr1Q64336 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tbr1Q64336 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tbr1Q64336 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tbr1Q64336 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tbr1Q64336 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tbr1Q64336 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tbr1Q64336 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tbr1Q64336 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tbr1Q64336 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tbr1Q64336 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tbr1Q64336 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tbr1Q64336 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tbr1Q64336 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tbr1Q64336 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tbr1Q64336 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tbr1Q64336 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tbr1Q64336 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tbr1Q64336 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tbr1Q64336 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tbr1Q64336 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tbr1Q64336 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tbr1Q64336 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tbr1Q64336 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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