Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
JrkQ60976 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
JrkQ60976 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms