Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms