Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Rnf215Q5SPX3 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf215Q5SPX3 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Rnf215Q5SPX3 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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Rnf215Q5SPX3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms