Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Lama5-201ENSMUST00000015791 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Nfrkb-201ENSMUST00000086167 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Ncbp3-201ENSMUST00000021135 12106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Xpo7-201ENSMUST00000022696 4472 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm44062-201ENSMUST00000203312 4857 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Dsg1a-201ENSMUST00000077146 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Stk36-201ENSMUST00000087183 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Zfp446-201ENSMUST00000045810 4615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Zfp275-201ENSMUST00000033731 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Stard13-201ENSMUST00000062015 5526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Ldlr-201ENSMUST00000034713 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms