Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms