Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms