Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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NfiaQ02780 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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NfiaQ02780 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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NfiaQ02780 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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