Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms