Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms