Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC8.27□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms