Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms