Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Smarcc1P97496 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Smarcc1P97496 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smarcc1P97496 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Smarcc1P97496 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smarcc1P97496 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smarcc1P97496 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Smarcc1P97496 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Smarcc1P97496 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smarcc1P97496 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smarcc1P97496 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smarcc1P97496 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smarcc1P97496 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smarcc1P97496 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smarcc1P97496 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Smarcc1P97496 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Smarcc1P97496 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Smarcc1P97496 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Smarcc1P97496 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Smarcc1P97496 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Smarcc1P97496 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Smarcc1P97496 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Smarcc1P97496 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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