Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Irx1P81068 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx1P81068 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx1P81068 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx1P81068 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx1P81068 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx1P81068 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx1P81068 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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