Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RorcP51450 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RorcP51450 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RorcP51450 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RorcP51450 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RorcP51450 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RorcP51450 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms