Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtpreP49446 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PtpreP49446 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtpreP49446 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtpreP49446 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtpreP49446 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PtpreP49446 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PtpreP49446 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtpreP49446 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtpreP49446 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtpreP49446 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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