Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms