Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms