Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm27817-201ENSMUST00000184302 233 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm3052-201ENSMUST00000186409 829 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm28448-201ENSMUST00000188547 428 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm18414-201ENSMUST00000210858 694 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 AC127302.1-201ENSMUST00000215973 1111 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Olfr1465-201ENSMUST00000080142 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 AC132833.1-202ENSMUST00000228875 1690 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm14617-201ENSMUST00000128053 798 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Olfr75-ps1-201ENSMUST00000135477 938 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm28298-201ENSMUST00000185287 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm28127-201ENSMUST00000185293 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm29318-201ENSMUST00000185308 975 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm28176-201ENSMUST00000185322 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm29532-201ENSMUST00000185593 622 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm29315-201ENSMUST00000185844 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm29581-201ENSMUST00000186083 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm28296-202ENSMUST00000186151 622 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm29210-201ENSMUST00000186332 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm29498-201ENSMUST00000186449 537 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm28761-201ENSMUST00000186540 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm28170-201ENSMUST00000186892 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm28326-201ENSMUST00000187043 622 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm28073-201ENSMUST00000187174 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm28725-201ENSMUST00000187372 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm28301-201ENSMUST00000187582 537 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm28464-201ENSMUST00000187726 622 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm29655-201ENSMUST00000187728 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm28280-201ENSMUST00000188196 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm28295-201ENSMUST00000188322 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm28091-201ENSMUST00000188421 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm29215-202ENSMUST00000188659 621 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm28697-202ENSMUST00000188821 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm28521-201ENSMUST00000188948 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms