Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Psmb9P28076 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms