Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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