Protein–RNA interactions for Protein: P26039

Tln1, Talin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,541 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tln1P26039 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tln1P26039 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tln1P26039 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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Tln1P26039 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Tln1P26039 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tln1P26039 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tln1P26039 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tln1P26039 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms