Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
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