Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm26865-201ENSMUST00000180970 3284 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Cgrrf1-203ENSMUST00000133989 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm20821-201ENSMUST00000179829 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
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