Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
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Ccl20O89093 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Ccl20O89093 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Ccl20O89093 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Ccl20O89093 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Ccl20O89093 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Ccl20O89093 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Ccl20O89093 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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