Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ldb2O55203 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ldb2O55203 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ldb2O55203 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ldb2O55203 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ldb2O55203 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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