Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Q1O19441 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Q1O19441 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Q1O19441 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Q1O19441 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Q1O19441 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Q1O19441 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Q1O19441 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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H2-Q1O19441 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Q1O19441 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Q1O19441 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Q1O19441 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Q1O19441 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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H2-Q1O19441 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Q1O19441 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Q1O19441 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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H2-Q1O19441 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
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H2-Q1O19441 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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H2-Q1O19441 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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H2-Q1O19441 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Q1O19441 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Q1O19441 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Q1O19441 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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H2-Q1O19441 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Q1O19441 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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H2-Q1O19441 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-Q1O19441 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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H2-Q1O19441 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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