Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Casq1O09165 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Casq1O09165 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Casq1O09165 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Casq1O09165 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Casq1O09165 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Casq1O09165 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Casq1O09165 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Casq1O09165 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Casq1O09165 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Casq1O09165 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Casq1O09165 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Casq1O09165 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
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