Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Slc28a1-202ENSMUST00000119083 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Susd2-202ENSMUST00000095541 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Colq-205ENSMUST00000150054 2867 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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