Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms