Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms