Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr16A3KMN5 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms