Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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