Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Atp8b5A3FIN4 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Atp8b5A3FIN4 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp8b5A3FIN4 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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